Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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