Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-CQ95604 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms