Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP13Q92995 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP13Q92995 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP13Q92995 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms