Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C11orf40Q8WZ69 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms