Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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