Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBRM1Q86U86 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms