Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDZD4Q76G19 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms