Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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