Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms