Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SAMD13Q5VXD3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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