Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM164Q5U3C3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms