Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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