Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms