Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UVSSAQ2YD98 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms