Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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