Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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