Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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