Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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