Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDB1Q16531 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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DDB1Q16531 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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DDB1Q16531 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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DDB1Q16531 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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