Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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