Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms