Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
JMJD1CQ15652 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms