Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIP13Q15645 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms