Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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