Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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