Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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