Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RFTN1Q14699 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RFTN1Q14699 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RFTN1Q14699 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms