Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK13Q14004 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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