Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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