Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H2Q13888 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H2Q13888 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H2Q13888 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H2Q13888 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H2Q13888 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF2H2Q13888 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H2Q13888 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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