Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms