Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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