Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRQ13535 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRQ13535 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms