Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCOF1Q13428 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
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