Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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