Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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