Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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