Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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