Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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FOXD4Q12950 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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FOXD4Q12950 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FOXD4Q12950 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD4Q12950 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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FOXD4Q12950 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FOXD4Q12950 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD4Q12950 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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FOXD4Q12950 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD4Q12950 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD4Q12950 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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