Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFRD2Q12894 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms