Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms