Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms