Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms