Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms