Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms