Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms