Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTUD4Q01804 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms