Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMF1P82094 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMF1P82094 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMF1P82094 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms