Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113P62684 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms