Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK-21P61565 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms